Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sptan1P16546 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms