Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RhoP15409 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RhoP15409 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms