Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Spta1P08032 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms