Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms