Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.1 ms