Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Hdac5Q9Z2V6 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hdac5Q9Z2V6 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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