Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnft1Q9DCN7 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms