Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Atg4aQ8C9S8 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Atg4aQ8C9S8 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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