Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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Actn1Q7TPR4 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Actn1Q7TPR4 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Actn1Q7TPR4 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms