Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim17Q7TPM3 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim17Q7TPM3 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms