Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms