Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxa13Q62424 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms