Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms