Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PtprmP28828 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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