Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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