Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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PdgfaP20033 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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PdgfaP20033 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PdgfaP20033 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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