Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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