Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms