Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms