Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CtcflA2APF3 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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