Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Speer3W4VSP1 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Speer3W4VSP1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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