Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms