Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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