Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gtf3c6Q9D8P7 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms