Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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