Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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