Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms