Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Yipf3Q3UDR8 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms