Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc49-202ENSMUST00000065603 3017 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ano4-208ENSMUST00000182613 3880 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38404-201ENSMUST00000202005 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20072-201ENSMUST00000202231 292 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6063-201ENSMUST00000206958 485 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms