Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms