Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms