Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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