Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms