Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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DmdP11531 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DmdP11531 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DmdP11531 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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DmdP11531 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DmdP11531 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms