Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Ccl20O89093 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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