Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usf3B2RUQ2 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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