Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrit3W8DXL4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit3W8DXL4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms