Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5114W4VSN8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5114W4VSN8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms