Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top3bQ9Z321 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top3bQ9Z321 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms