Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd1Q9Z2E2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms