Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3Q9Z2D8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms