Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd4Q9Z2D7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms