Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tulp1Q9Z273 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms