Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn8Q9Z260 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn8Q9Z260 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms