Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccne2Q9Z238 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccne2Q9Z238 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms