Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RfxankQ9Z205 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxankQ9Z205 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms