Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip6Q9Z1Y4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip6Q9Z1Y4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip6Q9Z1Y4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms