Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lgr5Q9Z1P4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lgr5Q9Z1P4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms