Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr4Q9Z1L2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr4Q9Z1L2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms