Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nek4Q9Z1J2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek4Q9Z1J2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms